SECUENCIA DEL GENOMA DE UN AISLAMIENTO DEL VIRUS DE LA TRISTEZA DE LOS CÍTRICOS

Contenido principal del artículo

Jesús Di Carlo Quiroz-Velásquez
Ma. de los Ángeles Peña-del Río
Ma. Antonia Cruz-Hernández
Susana Fernández-Dávila
Maurilio González-Paz
Alberto Mendoza-Herrera

Resumen

El genoma de un aislamiento severo del virus de la tristeza de los cítricos (VTC) de México (CBG-VTC1) se secuenció en su totalidad. Los 19 300 nucleótidos (nt) del genoma se dividen en 12 marcos de lectura abierta (ORF’s) que codifican para 15 proteínas y dos regiones no traducibles (5’ y 3’-UTR). El primer marco de lectura abierta inició en el nucleótido 108 con un tamaño de 9587 nt, y codificó para tres proteínas traslapadas, una poliproteína de 357 kDa que contiene dos proteasas contiguas (P-PRO), una metiltransferasa (MTR) y una helicasa (HEL). El segundo ORF traslapó en los últimos 55 nt de las proteasas; éste codifica para una ARN polimerasa ARN-dependiente (RdRp) con un peso molecular de 47 kDa cuya función es la replicación. Los ORF’s del 2 al 10 codificaron 10 productos proteicos con un rango que va de 6 a 65 kDa. El genoma CBG-VTC1 presentó sintenia con genomas ya reportados, y difirió solamente en 2 a 74 nt. La región 5’-UTR del CBG-VTC1 mostró 55 % de identidad con T30, 57.9 % con SY568, 100 % con T36 y solamente 58.9 % con VT, mientras que la región 3’-UTR tuvo 96 % de identidad en todos los aislamientos. La identidad aminoacídica promedio fue de 87.0 % con un aislamiento débil (T30) y de 85.9 %, 93.7 % y 85.13 % con las razas severas SY568, T36 y VT, respectivamente.

Detalles del artículo

Sección
Artículo Científico

Artículos más leídos del mismo autor/a

Artículos similares

También puede {advancedSearchLink} para este artículo.